广义飞蛾藤属(旋花科)的分支系统学分析

基于33个广义的形态学性状,对广义飞蛾藤属Porana s．l．进行了分支系统学分析。经过简约性分析,得到了10个同等简约的分支树。10个同等简约树的严格一致化树表明,广义飞蛾藤属是一较为自然的分类群。与广义飞蛾藤属的孢粉学、种皮微形态学研究结果一致,分支分析的结果不支持将广义飞蛾藤属拆分为4个或5个独立的属,应在属内划分分类等级。在整个形态分支树中广义飞蛾藤属4个亚属呈并列2个分支,其中飞蛾藤亚属(subg．Porana)和白花叶亚属(subg．Poranopsis)形成姐妹群构成一分支,三翅藤亚属(subg．Tridynamia)和棒状亚属(subg．Dinetus)以姐妹群的关系构成另一支。鉴于分支分析的Bootstrap支持率不高,广义飞蛾藤属范畴的最后界定和属内等级的划分仍有待于进一步研究。     

SARS病毒基因组的多态性

对SARS病人粪便样本直接测序,得到SRAS—CoV BJ202全基因组序列（AY864806）。应用比较基因组研究方法对GenBank中公布的115株SARS—CoV基因组序列以及BJ202进行分析。以GZ02序列为参照,发现2个以上基因组中同时存在单核苷酸多态（SNP）位点共278个。多态位点在SARS—CoV基因组中呈偏态分布,大约一半突变位点（50．4％,140／278）发生在基因组3’末端1／3区域。编码Orf10-11、Orf3／4、E蛋白、M蛋白和S蛋白区域突变率较高。克隆并测序含有BJ202基因组12个多态位点的11个cDNA以及4个不含已知多态位点的cDNA片段（15个片段总长度为6．0kb）,结果显示：BJ202特有的3个多态位点（13804、1503l和20792）以及另外3个多态位点（26428、26477和27243）均检出两种不同核苷酸;位点18379虽在已公布的115株SARS—CoV基因组中未发现突变,实际上也是多态位点。14个克隆中有8个克隆该位点为A,6个克隆为G。全部116个SARS—CoV基因组中共有18种缺失类型和2种插入类型。大部分缺失发生在编码ORF9和ORF10-11区域（基因组序列27700—28000bp处）。以邻位连接法（Neighbor-Joining）构建了116株SARS—CoV系统发育树,BJ202与BJ01和LLJ-2004等SARS—CoV的亲缘关系较接近。     

柔红霉素产生菌SIPI-1482中dnmV基因功能的阻断及恢复

dnmV基因产物为柔红霉素生物合成途径中TDP-6-脱氧己糖C4酮基还原酶,破坏该基因能阻断柔红糖胺的合成,进而阻断柔红霉素的产生。从天蓝淡红链霉菌(S. coeruleorubidus)SIPI-1482基因组DNA中经PCR扩增出dnmV及其上游dnmU基因片段,并由此构建了用于阻断dnmV基因的同源重组质粒pYG817,转化SIPI-1482菌株后成功地破坏了dnmV基因,发酵结果显示阻断突变株不再代谢产生柔红霉素,为引入新的基因来改变代谢产物的糖基结构打下了基础。通过导入dnmV基因表达质粒可重建该突变株的生物合成途径,恢复产生柔红霉素,但产量比出发菌株要低。     

Polymorphism of SARS-CoV Genomes

In this work, severe acute respiratory syndrome associated coronavirus (SARS-CoV) genome BJ202 (AY864806) was completely sequenced. The genome was directly accessed from the stool sample of a patient in Beijing. Comparative genomics methods were used to analyze the sequence variations of 116 SARS-CoV genomes (including BJ202) available in the NCBI Gen-Bank. With the genome sequence of GZ02 as the reference, there were 41 polymorphic sites identified in BJ202 and a total of 278 polymorphic sites present in at least two of the 116 genomes. The distribution of the polymorphic sites was biased over the whole genome. Nearly half of the variations (50.4%, 140/278) clustered in the one third of the whole genome at the 3′ end (19.0 kb-29.7 kb). Regions encoding Orf10-11, Orf3/4, E, M and S protein had the highest mutation rates. A total of 15 PCR products (about 6.0 kb of the genome) including 11 fragments containing 12 known polymorphic sites and 4 fragments without identified polymorphic sites were cloned and sequenced. Results showed that 3 unique polymorphic sites of BJ202 (positions 13 804, 15 031 and 20 792) along with 3 other polymorphic sites (26 428, 26 477 and 27 243) all contained 2 kinds of nucleotides. It is interesting to find that position 18379 which has not been identified to be polymorphic in any of the other 115 published SARS-CoV genomes is actually a polymorphic site. The nucleotide composition of this site is A (8) to G (6). Among 116 SARS-CoV genomes, 18 types of deletions and 2 insertions were identified. Most of them were related to a 300 bp region (27 700-28 000) which encodes parts of the putative ORF9 and ORF10-11. A phylogenetic tree illustrating the divergence of whole BJ202 genome from 115 other completely sequenced SARS-CoVs was also constructed. BJ202 was phylogeneticly closer to BJ01 and LLJ-2004.     

缘脊叶蝉亚科生物地理学研究(同翅目,叶蝉科)

对缘脊叶蝉亚科的组成,族、属和种的地理分布,以及起源与扩散途径进行了研究.结果表明:缘脊叶蝉亚科由7族57属323种组成,只分布于旧世界(Old World).7个族在非洲区均有分布,古北区有4个族、东洋区3个族、澳洲区2个族.依种类分布情况对4大动物区的相似性分析表明,东洋区与古北区关系最为密切,其次是澳洲区,与非洲区的相关性较小,这与地球演化历史是相吻合的.通过对各族地理分布及起源时间分析,它们的起源时间依次是:Drabescini、Paraboloponini、Selenocephalini、Ianeirini、Adamini、Dwightiini和Hypacostemmini.文中给出了各族的地理分布图.     

管茎叶蝉属分类并记一新种(半翅目,缘脊叶蝉亚科,脊翅叶蝉族)

记述中国脊翅叶蝉管茎叶蝉属1新种Fistulatus rectilineus Shang＆Zhang,sp.nov.并给出本属所有种的检索表,新种模式标本分别保存在中国农业大学和南开大学.新种与Fistulatusluteolus Cen＆Cai,2002的区别为：1）尾节侧瓣具1个突起而不是2个;2）阳茎干不背向弯曲;3）阳茎干背缘两侧各具一凸缘,近端部有一窄三角形凸缘.     

Study of selective feeding in the marine cladoceran Penilia avirostris by HPLC pigment analysis

Food selection by the marine cladoceran Penilia avirostris was studied in the field by HPLC analysis of phytoplankton marker pigments and in the laboratory by microscopic measurement of cell removal. Comparison between pigment composition in natural phytoplankton and in P. avirostris showed that P. avirostris preferred diatoms, cryptophytes and chlorophytes, and ignored prymnesiophytes and dinoflagellates. Peridinin, the marker pigment for dinoflagellates was found in P. avirostris only when the dinoflagellate populations were dominated by Prorocentrum. Pigment degradation rates ranged from 13.73% for alloxanthin to 36.62% for chlorophyll a. Clearance rates measured in the laboratory provided further evidence of strong preference for diatoms and cryptophytes, and avoidance of dinoflagellates. Microscopic counts suggested that P. avirostris was feeding on prymnesiophytes, although ingestion of prymnesiophytes could not be confirmed by pigment analysis.     

贵州中三叠世早期幻龙属(Nothosaurus)一新种

作为三叠纪海生爬行动物的重要分子,幻龙属化石主要发现于欧洲、中东和中国西南地区的中三叠世海相地层,且主要集中分布于安尼期晚期和拉丁期晚期(Edinger,1921;Haas,1980;Rieppel,2000)。我国目前已报道的幻龙属化石有两种：杨氏幻龙(Li and Rieppel,2004)和幻龙属未定种(Rieppel,1998),它们均产于贵州省兴义地区的法郎组竹杆坡段,时代为中三叠世拉丁期。最近在贵州省盘县地区关岭组Ⅱ段地层中也发现了数量较多的幻龙骨骼化石,证明中三叠世早期东特提斯区同样生存着幻龙类。鉴于标本的骨骼特征与已知的幻龙属种相比存在一定的差异,因此本文建立一新种Nothosaurus rostellatus sp．nov．(小吻幻龙)。新种的个体在幻龙属种中为中等(头骨中线长210～320mm);吻部短而小,具4个前颌骨獠齿,紧随其后是第5个明显较小的前颌齿;一对上颌骨犬齿之前有6～9个小型上颌齿;眼窝较大,卵圆形,位置相对靠前;内鼻孔的后缘由腭骨构成,具内鼻槽;外翼骨形成腹向凸缘;下颌具冠状突;背椎神经棘较低,背肋肩部明显加厚。N．rostellatus与其他已知种的主要区别特征是吻部形态和比例。新种的吻部较小,长略大于宽,前端钝圆,基部明显收缩,其吻部长度(从吻端至外鼻孔前端的距离)仅占其头骨中线长度的1/6～1/7,而其他种一般占1/4～1/5,具有细长吻部的N．haasi甚至接近1/3。此外,新种吻端-上颞孔前缘距离与吻端-外鼻孔前缘距离的比值也明显高于其他种。N．rostellatus区别于其他幻龙种的另一主要特征是上颌骨牙齿的数目和排列。在已知的幻龙属种中,很少有一对上颌犬齿前的上颌齿数超过5个者。新种正型标本ⅣPPⅤ14294在一对上颌犬齿前具有6个小型锥状上颌齿,它们大小相等,指向腹方。副型标本ⅣPPⅤ14301在一对上颌犬齿前具有9个小型锥状上颌齿。在已知的Nothosaurus中,新种与N．youngi Li & Rieppel,2004和N．marchicus Koken,1893无论是个体大小还是头骨形态均比较接近,如具有相对短而宽的吻部和较短的上颌齿列、相似的鼻骨形态等,与其他种相差较大,因此这里仅对新种与此二种之间的异同做简要的介绍。从头骨的一些具体形态特征看,N．rostellatus的鼻骨后侧方与前额骨相连,阻隔了额骨和上颌骨,该特征与N．youngi相同而不同于N．marchicus,后者鼻骨受额骨与上颌骨的阻隔,不与前额骨相连。如果不考虑鳞骨的外侧分支的宽度,Ⅴ14294和Ⅴ14301与N．youngi的头骨的最宽处均位于轭骨的后端位置,且其宽度为吻部宽度的2．6～3．5倍(其中N．youngi为2．6倍,Ⅴ14294为3倍,Ⅴ14301为3．5倍),而N．marchicus的最宽处位于头骨后部鳞骨的分支处,其轭骨后缘处头骨宽度为吻部宽度的2～2．8倍(Rieppel and Wild,1996,fig．36,41)。此外,N．rostellatus外翼骨形成腹向突起和下颌具冠状突的特点也与N．youngi相同,N．marchicus不具有该特征。另一方面,N．rostellatus的枕部特征则与N．marchicus接近而不同于N．youngi。新种的枕部内凹,枕骨侧边的后耳骨等向后侧部延伸,下颌关节在头骨后部位于枕髁之后,该枕部特征与N．marchicus一致。N．youngi的下颌关节与枕髁基本位于一个平面内,因此枕部未形成明显的内凹。新种的眼眶与上颞孔之间的距离相对较宽,其中V 14294眼眶与上颞孔之间的距离与外鼻孔与眼眶之间的距离接近相等,而V 14301眼眶与上颞孔之间的距离大于外鼻孔与眼眶之间的距离。此特征也与N．marchicus相同而不同于N．youngi,前者眼眶与上颞孔之间的距离与外鼻孔与眼眶之间的距离相等,后者的眶后弓很窄,其眼眶与上颞孔之间的距离小于外鼻孔与眼眶之间的距离的1/2。N．rostellatus鼻骨的左右两前突分别伸至两外鼻孔的前缘内侧,位置与N．marchicus相同,而N．youngi鼻骨前突仅伸至外鼻孔内侧缘的中部。N．rostellatus前颌骨的背突向后伸至外鼻孔后缘之后,接近鼻骨的后缘,而N．youngi仅伸至外鼻孔后缘中间部位。除前文所述新种两个主要鉴定特征外,N．rostellatus又以具有内鼻槽,翼骨前伸至内鼻槽附近等特征与该已知二种相区别。此外,新种前颌骨具外侧支突起,其他种该特征多不明显,如N．jagisteus不存在前颌骨外侧支突起,其前颌骨在外鼻孔的前外侧缘沿前外侧方向与上颌骨相交(Rieppel,2001)。从地理分布和地层层位看,N．marchicus主要分布于欧洲中部的中三叠统安尼阶,而N．youngi则分布于我国贵州南部的中三叠统拉丁阶。本文描述的化石产于贵州南部关岭组Ⅱ段,其时代应相当于中三叠世晚安尼期。N．rostellatus与分布于欧洲的同时期的幻龙N．marchicus以及与在其后约7～8Ma相邻地区出现的M．youngi的亲缘关系的远近可能还需要更深入的研究来证实。     

兔眼越桔(杜鹃花科)花粉形态——兼谈用极坐标测量四合体花粉的一种新方法

扫描电镜下,兔眼越桔花粉为四合体,外形为准四面体,中等大小,表面具不规则皱波状纹饰,并有多处凹陷。萌发孔沟多为3对(顶分体3条,侧分体各对应1条),以四面体几何中轴为中心,中心对称分布于四面体的3个侧面。萌发孔沟的长度、宽度、孔盖长与宽、孔盖的形状、突起的程度等,在个体间有差异,尤其是一些具有多处凹陷的花粉粒,可能是导致花粉萌发率不同的生态类型。用极坐标法描述四合体花粉的新方法可以表现其饱满度,比较传统上用极轴、赤道轴的长短表现花粉平面大小的方法,更加准确而直观。     

异三聚体G蛋白在NAA诱导的拟南芥根生长发育中的作用

以拟南芥的野生型(ws)、异三聚体G蛋白α亚基基因GPA1缺失突变体(gpa1-1,gpa1-2)和超表达突变体(wGα,cGα)为材料,通过施加不同浓度(0~0.2 mg/L)的NAA处理,对拟南芥根生长发育的一些形态指标进行了观测比较.结果表明:(1)随着培养基中NAA浓度的不断升高,5种基因型主根的伸长生长均受到抑制,且抑制作用随浓度升高而增强;4种突变体和野生型主根的生长在相同浓度NAA处理下,无明显差异;(2)NAA在一定浓度范围内,对拟南芥侧根的生长发育起促进作用;在NAA诱导的侧根生长中,G蛋白超表达突变体比野生型更敏感,缺失突变体则不敏感.初步证明G蛋白不参与主根生长发育的调节,而在侧根生长发育中可能起正调节作用.